清洗的目的是将污物带离物体外表，溶解（至少是悬浮）在清洁剂里，并经过漂洗彻底脱离复用器械。清洗是一个复杂的过程，清洁剂的选择也应该满足多方面的要素。清洁剂应该具有较强的去污才能，与清洗的器械和清洗机有良好的相容性，并且易于漂洗，减少残留。
非研磨产品，不毁坏器械；低泡；可漂洗；可生物降解；快速合成污染物；对各种临床污染物有效；有效期长；本钱优势。人体组织块、血迹和体液中含有蛋白质和脂类，这些物质并不能溶解于水溶液中。
含酶清洁剂内的各种水解酶可以将蛋白质和脂类合成成其分子量相对较小的组成成分，肽段、脂肪酸、甘油等，从而加强在水溶液中的溶解与悬浮才能，进步清洗的效果。依据含酶清洁剂的特性，一款理想的含酶清洁剂应该具备：优良的去污才能；腐蚀性弱，与器械有良好的兼容性；较低的泡沫程度；气息温和不刺激；酶活性高，稳定性好；水溶液坚持透明；组分平安环保。
生物膜是细菌存在的一种方式，细菌在其分泌的粘性基质中共同抵御外部环境的应战。医疗器械在重复运用中带来生物膜的积聚，成熟的生物膜厚度可达300个细菌直径，普通的清洗办法很难将其彻底肃清。
